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Text File  |  1995-03-04  |  3.0 KB  |  61 lines
  1. *******************************************
  2. * Microbodies C-terminal targeting signal *
  3. *******************************************
  4.  
  5. Microbodies are  a class of small, single membraned organelles to which belong
  6. peroxisomes, glyoxysomes,  and  glycosomes. Microbody proteins are synthesized
  7. on free polysomes and imported into the organelle post-translationally. Unlike
  8. the import  of  proteins  into  mitochondria, chloroplasts or the ER/secretion
  9. pathway, import  into  microbodies does not generally require the removal of a
  10. presequence [1].  It  has  been  experimentally  shown  [2,3,4]  that, in some
  11. peroxisomal proteins,  the  targeting  signal  (PTS) resides in the last three
  12. amino acids  of  the  C-terminus.  This consensus sequence is known as 'S-K-L'
  13. (Ser-Lys-Leu), although some variations are allowed in all three positions. As
  14. the peroxisomal  targeting  signal  also  seems  to    be  recognized by other
  15. microbodies, it  is now [1] known as the C-terminal microbody targeting signal
  16. (CMTS).
  17.  
  18. It must  be noted that not all microbody proteins contain a CMTS; some seem to
  19. contain an  internal  CMTS-like  sequence,  but  it  is not yet known if it is
  20. active as such. Finally, a  few  proteins are  synthesized  with an N-terminal
  21. presequence which is cleaved off during import.
  22.  
  23. Microbody proteins known or thought to contain a CMTS are listed below.
  24.  
  25.  - Mammalian D-amino acid oxidase.
  26.  - Mammalian acyl-coenzyme A oxidase (but not the fungal enzymes).
  27.  - Mammalian trifunctional fatty acid beta oxidation pathway enzyme.
  28.  - Mammalian, insect, plants, and Aspergillus uricase.
  29.  - Mammalian sterol carrier protein-2 high molecular form (SCP-X).
  30.  - Mammalian long chain alpha-hydroxy acid oxidase.
  31.  - Mammalian soluble epoxide hydrolase (sEH).
  32.  - Firefly luciferase.
  33.  - Plants glycolate oxidase.
  34.  - Plants glyoxisomal isocitrate lyase.
  35.  - Plants glyoxisomal malate synthase.
  36.  - Trypanosoma glycosomal glucose-6-phosphate isomerase.
  37.  - Trypanosoma glycosomal glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase.
  38.  - Yeast (H. polymorpha and Pichia pastoris) alcohol oxidase (AOX).
  39.  - Yeast (H. polymorpha) dihydroxy-acetone synthase (DHAS).
  40.  - Yeast (S. cerevisiae) carnitine o-acetyltransferase.
  41.  - Yeast (S. cerevisiae) catalase A.
  42.  - Yeast (S. cerevisiae) citrate synthase.
  43.  - Yeast (S. cerevisiae) peroxisomal malate dehydrogenase.
  44.  - Yeast (C. boidinii) peroxisomal protein PMP20.
  45.  - Yeast (C. tropicalis) hydratase-dehydrogenase-epimerase  (HDE)  from  fatty
  46.    acid beta oxidation pathway.
  47.  - Yeast (C. tropicalis) isocitrate lyase.
  48.  
  49. -Consensus pattern: [SAGCN]-[RKH]-[LIVMAF]>
  50. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  51.  
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  61.